Thelypteris palustris Schott, 1834

Cette espèce est rare en Franche-Comté et distribuée de manière très disséminée. Elle est présente dans la vallée de l’Ain à Cernon, Onoz, Soucia et Doucier, la région des lacs à Bonlieu, la Chaux-du-Dombief et au Frasnois, l’axe des Hautes-Joux à Etival et Châtel-de-Joux, puis à Viry, sur les plateaux du Doubs à Frasne, Bulle et Passonfontaine, en Bresse à Balanod, Larnaud, Fontainebrux, Chapelle-Voland, Chaumergy, Biefmorin et Pleure, dans la plaine doloise à Our, le faisceau de Quingey à Liesle, la plaine de Gray à Cresancey, la vallée de l’Ognon à Beaumotte-Aubertans et Marast, le Dôme sous-vosgien à Saulnot, la vallée de la Lanterne à Conflans-sur-Lanterne, la dépression sous-vosgienne à Visoncourt, Citers et Linexert, et le massif vosgien à Saint-Bresson. Elle est à retrouver dans l’axe des Grands Vaux à Grande-Rivière et Labergement-Sainte-Marie, le bassin du Drugeon à Bonnevaux, en Bresse à Foulenay, dans la plaine doloise à Moissey et la dépression sous-vosgienne à Lure. Au XIXe siècle, elle était mentionnée à Dole et Neublans-Abergement.

La fougère des marais est une plante d’ombre mais poussant parfois en pleine lumière qui apprécie les atmosphères humides et les sols tourbeux très humides. Elle est liée aux aulnaies et saulaies marécageuses des Alnetea glutinosae et est caractéristique des phragmitaies mésotrophes des tourbes en cours de minéralisation du Thelypterido palustris – Phragmitetum australis, communauté à rechercher dans la région. Elle s’observe également dans des tourbières, au bord des tremblants colonisant les lacs et dans les prairies humides oligotrophiles à mésotrophiles subatlantiques des sols hydromorphes du Junco conglomerati – Molienion caeruleae.