Polygala amarella Crantz, 1769

En Franche-Comté, cette espèce est principalement présente dans le massif du Jura où elle est répandue dans le Haut-Jura, l’est de la Petite Montagne, la Combe d’Ain, les plateaux entre Salins-les-Bains et Champagnole, de Levier, de Frasne et entre Loue et Dessoubre. Elle est disséminée sur le reste des plateaux du Doubs, dans la vallée de la Loue, la zone urbaine de Belfort et dans les Vosges comtoises de Servance à Lepuix. Ailleurs, elle est rare dans l’ouest de la Petite Montagne, les monts de Gy à Bucey-lès-Gy, la plaine de Gray à la Vernotte et les plateaux calcaires de l’ouest de la Haute-Saône à Larret et Pierrecourt. Elle est à retrouver à Besançon, Champvans, dans plusieurs communes des plateaux du Doubs et était indiquée dans la région de Salins-les-Bains, à Nans et dans la région de Luxeuil-les-Bains au XIXe siècle.

Le polygale amer est une plante héliophile appréciant les sols frais, riches en bases, pauvres en nutriments et riches en matière organique. Il fréquente notamment les pelouses montagnardes mésophiles et généralement pâturées du Gentiano vernae – Brometum erecti, les pelouses montagnardes, sous microclimat froid et généralement pâturées du Koelerio pyramidatae – Seslerietum caeruleae, les pelouses marnicoles du Tetragonolobo maritimi – Bromenion erecti, les bas-marais alcalins du Caricetum davallianae, les prairies humides montagnardes du Calthion palustris, les prairies humides oligotrophiles sur sol paratourbeux du Molinion caeruleae et les communautés des tourbières alcalines et de transition du Caricion lasiocarpae.